莫拉克重建會蒐集各地方政府提報的山崩、土石流災害後，為進一步分析周遭地質環境是否仍屬於安全的居住地，莫拉克重建會特將這些資料整合後，委託中華民國工程環境學會等相關專業機構進行原住民與非原住民地區之「安全」與「不安全」的評估工作。例如在委託中華民國工程環境學會所調查的非原住民現有41處聚落的安全評估工作，包括雲林縣1個聚落；嘉義縣20個聚落；以及高雄縣20個聚落。初步安全評估調查結果顯示，41個聚落中，有13個聚落屬於「不安全」的狀況；17個聚落屬於「安全」的狀況，10個聚落屬於「有條件性安全」的狀況，有1處分配永久屋，對於有安全顧慮或有條件性安全的聚落，除進行土沙災害防制與複合型災害防制之外，亦透過協調安置會議，配合居民意願，進行搬遷或安置作業，期以走出傷痛，迎向未來。

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