有關電子檔案清查請依據「文書及檔案管理電腦化作業規範」第18點第16至17款及機關檔案管理作業手冊第12章入庫管理之12.4.3.5規定辦理。檔管局亦於e等公務園+學習平臺提供「A501電子檔案管理概述」線上課程，歡迎多加利用。

檔案管理系統提供之電子檔案清查功能，如經確認符合前開規範之規定，請依機關年度清查計畫所訂範圍於系統中辦理電子檔案清查；惟若系統未具備電子檔案清查功能或無法確認符合前開規範時，得使用本局開發之電子封裝檔工具箱進行清查，請至本局電子檔案保存實驗室網站下載軟體及操作手冊(如附檔)，或洽詢實驗室聯絡電話02-25136068。